More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  60.21 
 
 
303 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  56.55 
 
 
308 aa  338  8e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  54.21 
 
 
301 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  53.14 
 
 
303 aa  298  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  53.12 
 
 
319 aa  295  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  55.43 
 
 
319 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.92 
 
 
349 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  47.15 
 
 
338 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  46.93 
 
 
324 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  47.06 
 
 
304 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 
367 aa  255  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  42.27 
 
 
358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  45.17 
 
 
330 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  45.36 
 
 
301 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  48.99 
 
 
337 aa  249  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  47.71 
 
 
310 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  46.75 
 
 
306 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  42.73 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  41.67 
 
 
351 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  46.82 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  48.14 
 
 
317 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  46.38 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  40.42 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  43.05 
 
 
330 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  42.38 
 
 
331 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  43.52 
 
 
325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  43.57 
 
 
384 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  43.75 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  47.51 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  48.81 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  46.15 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  41.69 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  47.92 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  45.13 
 
 
337 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  42.56 
 
 
408 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  42.27 
 
 
322 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  42.72 
 
 
334 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  40.52 
 
 
421 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  40.52 
 
 
377 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  45.4 
 
 
324 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  44.88 
 
 
351 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  46.55 
 
 
290 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  45.87 
 
 
311 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  46.55 
 
 
290 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  46.55 
 
 
290 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  47.6 
 
 
294 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  40.42 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  43.43 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  44.22 
 
 
291 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  47.93 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  45.45 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  44.72 
 
 
351 aa  212  7.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  40.96 
 
 
327 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  48.12 
 
 
259 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  45.27 
 
 
299 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  43.67 
 
 
295 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  41.69 
 
 
375 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  46.5 
 
 
306 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  44.22 
 
 
291 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  44.22 
 
 
291 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  40.73 
 
 
329 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  41.45 
 
 
341 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  42.37 
 
 
291 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  41.97 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  39.62 
 
 
318 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  40.14 
 
 
361 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  40.27 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  39.79 
 
 
309 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  40.54 
 
 
349 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  40.82 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.1 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  41.16 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  40.82 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  40.54 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  35.2 
 
 
510 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  36.81 
 
 
325 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  37.02 
 
 
433 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  35.79 
 
 
742 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.63 
 
 
751 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.23 
 
 
826 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.07 
 
 
586 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  36.33 
 
 
517 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  35.07 
 
 
319 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  34.19 
 
 
481 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 
829 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.99 
 
 
398 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.46 
 
 
517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  36.54 
 
 
314 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  34.94 
 
 
390 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.59 
 
 
267 aa  122  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 
628 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.71 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  33.97 
 
 
316 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  30.94 
 
 
259 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  34.22 
 
 
766 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.42 
 
 
614 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.08 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1031  protein of unknown function DUF323  34.3 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  34.17 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>