More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25940 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  68.98 
 
 		 276 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  66.01 
 
 		 286 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  62.6 
 
 		 283 aa  326  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  62.99 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  60.62 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  60.62 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  60.23 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  57.24 
 
 		 304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.2 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  58.85 
 
 		 284 aa  304  9.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  59.29 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  57.59 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.75 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  57.53 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  58.37 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  57.03 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  59.68 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  51.71 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  52.33 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  52.87 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  46.95 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.86 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.2 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  24.65 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  34.36 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  34.39 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  34.38 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  34.38 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  34.38 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  34.36 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  34.38 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.51 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  34.2 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.86 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.53 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.34 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  29.9 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  29.9 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  27.5 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  31.02 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  29.9 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  30.16 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  27.23 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.57 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  35.6 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  30.24 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  33.16 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  28.08 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.91 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.9 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  31.51 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.9 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  31.06 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  29.84 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.89 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  23.26 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  25.73 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.52 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.3 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.71 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  32.96 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>