More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  76.97 
 
 
310 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  71.8 
 
 
307 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  71.8 
 
 
307 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  71.8 
 
 
307 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  69.71 
 
 
307 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  73.94 
 
 
307 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  69.06 
 
 
307 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  70.68 
 
 
307 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  67.21 
 
 
312 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
311 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  64.1 
 
 
312 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  64.59 
 
 
323 aa  381  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  64.08 
 
 
322 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  62.42 
 
 
315 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
308 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 
321 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  59.74 
 
 
338 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  57.78 
 
 
310 aa  360  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  59.42 
 
 
327 aa  358  6e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  61.46 
 
 
314 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  58.54 
 
 
330 aa  352  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  62.21 
 
 
306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  58.6 
 
 
310 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  57.84 
 
 
306 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  57.14 
 
 
340 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  56.13 
 
 
308 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 
314 aa  332  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  54.84 
 
 
321 aa  330  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  57.56 
 
 
310 aa  328  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  59.02 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
333 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  57.7 
 
 
312 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  53.4 
 
 
335 aa  321  8e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  59.08 
 
 
319 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  55.34 
 
 
317 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.11 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  51.19 
 
 
306 aa  301  8.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
314 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.54 
 
 
305 aa  293  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  52.43 
 
 
315 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 
323 aa  291  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
303 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
303 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  50.65 
 
 
313 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  51.78 
 
 
303 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  48.83 
 
 
355 aa  286  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.21 
 
 
312 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  49.15 
 
 
305 aa  285  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
305 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  47.87 
 
 
311 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
309 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
309 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
306 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 
318 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.31 
 
 
312 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
305 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
306 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
308 aa  275  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  45.87 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
309 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1323  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.46051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  47.08 
 
 
309 aa  272  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 
316 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
303 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  44.77 
 
 
332 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.03 
 
 
309 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
304 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  46.95 
 
 
312 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
323 aa  269  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 
316 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
312 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
309 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1599  ornithine carbamoyltransferase  50.55 
 
 
312 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  44.48 
 
 
302 aa  265  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
312 aa  265  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  44.55 
 
 
316 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
307 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.39 
 
 
300 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 
302 aa  264  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
311 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  44.82 
 
 
305 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>