More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25570 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  76.13 
 
 
399 aa  641    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  100 
 
 
402 aa  823    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  75.82 
 
 
399 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  76.96 
 
 
402 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  75.81 
 
 
414 aa  634    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  76.31 
 
 
413 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  76.83 
 
 
400 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000388575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  75.7 
 
 
400 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  76.96 
 
 
399 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  77 
 
 
399 aa  648    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  75.44 
 
 
400 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  77.22 
 
 
403 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  75.44 
 
 
400 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  75.7 
 
 
400 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  75.7 
 
 
400 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  74.81 
 
 
402 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  75.56 
 
 
412 aa  626  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11676  argininosuccinate synthase  73.92 
 
 
398 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.33354e-18  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  76.65 
 
 
413 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  73.16 
 
 
412 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  73.42 
 
 
401 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  75.19 
 
 
401 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  73.42 
 
 
401 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  71.79 
 
 
413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  65.75 
 
 
400 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  66.5 
 
 
400 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  64.75 
 
 
412 aa  555  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  64.5 
 
 
404 aa  552  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  56.17 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  53.75 
 
 
464 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  55.24 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  54.18 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  52.67 
 
 
400 aa  435  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  53.38 
 
 
402 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  52.64 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
420 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 
401 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  51.52 
 
 
406 aa  428  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  52.64 
 
 
401 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  53.15 
 
 
401 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  52.64 
 
 
401 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
401 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  53.08 
 
 
401 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
401 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
396 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  50.87 
 
 
401 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  51.77 
 
 
406 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 
401 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  51.26 
 
 
400 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  53.4 
 
 
403 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  52.5 
 
 
403 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  51.01 
 
 
406 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  53.54 
 
 
398 aa  424  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  47.62 
 
 
413 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  50.75 
 
 
399 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
404 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  51.79 
 
 
400 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  53.02 
 
 
401 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  52.69 
 
 
410 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  50.89 
 
 
404 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
397 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  51 
 
 
410 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
399 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
404 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
399 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 
408 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
404 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  49.13 
 
 
404 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
406 aa  411  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  51.5 
 
 
400 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
397 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  48.5 
 
 
402 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  49.5 
 
 
401 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  49.22 
 
 
400 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 
400 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 
400 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  48.45 
 
 
400 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  48.59 
 
 
400 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  47.36 
 
 
402 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  48.45 
 
 
399 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  48.88 
 
 
408 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  48.07 
 
 
400 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  48.64 
 
 
399 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  46 
 
 
399 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  46.02 
 
 
1496 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
401 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  46.21 
 
 
401 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  44.78 
 
 
410 aa  362  6e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
404 aa  359  6e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  47.24 
 
 
399 aa  358  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  45.57 
 
 
403 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  46.46 
 
 
401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  44.64 
 
 
397 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  43.62 
 
 
407 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>