More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64.82 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.87 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1299  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.29 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.987107  normal  0.450444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18290  chromosome partitioning ATPase  48.45 
 
 		 255 aa  205  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.283097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.13 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  42.54 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.71 
 
 		 272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1545  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.05 
 
 		 278 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0482678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3091  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.7 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124174  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.86 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4176  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  31.47 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.79 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  31.17 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  33.75 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  28.74 
 
 		 250 aa  109  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1796  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.46 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.35 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  34.35 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.6 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  30.43 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.86 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.4 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.5 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.97 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.83 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.64 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  31.47 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  28.4 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 256 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 		 433 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  35.42 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 270 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 		 437 aa  99.4  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.37 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 		 264 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  32.4 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  31.17 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.22 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  31.47 
 
 		 253 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  31.25 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  29.34 
 
 		 258 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.36 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.86 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  29.34 
 
 		 254 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  33.93 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  32.11 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.83 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  31.74 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  31.74 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>