More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  100 
 
 
377 aa  735  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  56.14 
 
 
406 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  40.51 
 
 
409 aa  252  9e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  42.49 
 
 
410 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  44.09 
 
 
389 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  33.58 
 
 
395 aa  212  8e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  33.67 
 
 
396 aa  212  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  32.57 
 
 
384 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  32.92 
 
 
392 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  34.17 
 
 
398 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  32.92 
 
 
395 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  31.63 
 
 
384 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  33.67 
 
 
397 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  34.39 
 
 
390 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  31.96 
 
 
395 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  30.79 
 
 
385 aa  202  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  32.66 
 
 
396 aa  202  1e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2364  arsenite-activated ATPase ArsA  33.25 
 
 
395 aa  201  1e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  32.54 
 
 
408 aa  201  2e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  34.46 
 
 
406 aa  201  2e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  31.38 
 
 
384 aa  200  4e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  30.53 
 
 
384 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  32.56 
 
 
397 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  33.07 
 
 
400 aa  199  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  32.9 
 
 
392 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  31.73 
 
 
384 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  32.25 
 
 
395 aa  199  8e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  31.41 
 
 
394 aa  198  1e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  32.81 
 
 
408 aa  197  2e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  33.42 
 
 
399 aa  198  2e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  33.33 
 
 
407 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  39.84 
 
 
404 aa  196  4e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  31.47 
 
 
384 aa  196  5e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  32.81 
 
 
405 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  32.88 
 
 
396 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  32.13 
 
 
395 aa  196  8e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  32.17 
 
 
399 aa  195  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  32.31 
 
 
395 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  33.15 
 
 
396 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  31.66 
 
 
397 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  34.05 
 
 
404 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  32.55 
 
 
405 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  31.66 
 
 
397 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  31.76 
 
 
407 aa  193  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  32.11 
 
 
396 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  32.81 
 
 
433 aa  192  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  32.72 
 
 
405 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  31.75 
 
 
394 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  32.46 
 
 
405 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  31.56 
 
 
434 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  32.81 
 
 
401 aa  189  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  29.35 
 
 
397 aa  189  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  30.71 
 
 
434 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  27.46 
 
 
385 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  34.59 
 
 
391 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  30.71 
 
 
433 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  32.74 
 
 
406 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  32.11 
 
 
433 aa  184  2e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  30.23 
 
 
404 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  31.69 
 
 
433 aa  183  4e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  28.98 
 
 
393 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  28.46 
 
 
393 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  28.98 
 
 
392 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  31.33 
 
 
402 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  33.42 
 
 
397 aa  180  3e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  31.23 
 
 
433 aa  180  3e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  28.72 
 
 
393 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  28.72 
 
 
393 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  28.46 
 
 
393 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  28.72 
 
 
392 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  28.72 
 
 
393 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  28.54 
 
 
393 aa  176  7e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  34.26 
 
 
394 aa  175  1e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  34.93 
 
 
407 aa  175  1e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  36 
 
 
421 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  36 
 
 
421 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  36 
 
 
421 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3546  arsenite-transporting ATPase  36.47 
 
 
430 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.614872  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  36.14 
 
 
401 aa  162  8e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12212  hypothetical protein  35.54 
 
 
380 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2965  anion-transporting ATPase  34.24 
 
 
381 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  32.49 
 
 
345 aa  135  1e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  39.35 
 
 
169 aa  131  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  32.18 
 
 
344 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  31.75 
 
 
345 aa  130  4e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  32.78 
 
 
640 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  32.59 
 
 
314 aa  126  8e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  31.55 
 
 
345 aa  123  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  31.46 
 
 
643 aa  123  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  30.84 
 
 
341 aa  118  2e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  31.46 
 
 
456 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  3.94119e-07 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  26.09 
 
 
334 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  26.5 
 
 
334 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0450  arsenite-transporting ATPase  25.87 
 
 
334 aa  111  2e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0025028  hitchhiker  0.000316077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0875  anion-transporting ATPase  29.39 
 
 
364 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3644  arsenite-activated ATPase ArsA  33.84 
 
 
332 aa  106  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02909  arsenite ATPase transporter (Eurofung)  29.66 
 
 
340 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.307729  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2121  arsenical pump-driving ATPase  31.03 
 
 
586 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.32973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2187  arsenical pump-driving ATPase  31.03 
 
 
586 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  30.36 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>