201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 293 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  53.96 
 
 		 293 aa  300  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  51.42 
 
 		 282 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  52.14 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  48.38 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  48.57 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  50 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  48.24 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  48.73 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  44.6 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  47.99 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  46.67 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  44.84 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  46.95 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  47.31 
 
 		 284 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  42.46 
 
 		 410 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  46.76 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  45.42 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.67 
 
 		 284 aa  224  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  45.65 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  43.88 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  43.42 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  43.37 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  42.55 
 
 		 285 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  43.01 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  44.89 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  49.08 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  42.5 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  42.24 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  45.83 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  41.58 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  44.53 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  45.39 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  43.82 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  40.97 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.48 
 
 		 279 aa  205  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.54 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  43.12 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  40.67 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  38.44 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  46.3 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  40.89 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 281 aa  198  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  42.16 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  42.49 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  39.21 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.23 
 
 		 281 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  38.35 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  41.64 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  37.45 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  41.75 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  38.41 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  39.72 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  38.49 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  39.42 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.5 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  42.56 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  35.76 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  40.91 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  41.16 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  34.53 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  37.97 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  44.69 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  38.99 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  37.46 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  36.4 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 290 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  38 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.69 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  38.7 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.75 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  33.69 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  38.06 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>