More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  84.3 
 
 		 225 aa  328  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  75.12 
 
 		 222 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  74.19 
 
 		 222 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.34 
 
 		 220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.81 
 
 		 218 aa  294  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.28 
 
 		 223 aa  291  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.82 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  65.44 
 
 		 217 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.44 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 217 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  63.3 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.06 
 
 		 218 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.73 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  63.72 
 
 		 215 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.72 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 217 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.47 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.06 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  60.83 
 
 		 221 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 226 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  56.81 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.14 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 235 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  55.36 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.02 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.15 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 243 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  48.66 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  49.33 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.27 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 226 aa  181  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 240 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 230 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  42.01 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.01 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  44.14 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  44.14 
 
 		 224 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  43.17 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 236 aa  167  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.66 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.95 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  41.1 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.19 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.09 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.55 
 
 		 224 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.09 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>