239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
286 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.94 
 
 
278 aa  266  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.59 
 
 
278 aa  146  4e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.63 
 
 
271 aa  137  3e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 
289 aa  115  9e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.11 
 
 
266 aa  115  1e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 
244 aa  114  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  41.71 
 
 
316 aa  112  7e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.31 
 
 
298 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.39 
 
 
312 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.2 
 
 
591 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
639 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
236 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.98 
 
 
639 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.72 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.73 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.31 
 
 
837 aa  92.8  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.59 
 
 
328 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.72 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.63 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.61 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
328 aa  89  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
242 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  31.06 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 
644 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
576 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  29.72 
 
 
657 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.59 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
287 aa  85.5  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 
808 aa  83.6  4e-15  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
281 aa  83.6  4e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 
300 aa  82.4  9e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 
245 aa  81.6  1e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.55 
 
 
288 aa  80.9  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.86 
 
 
273 aa  80.9  2e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
226 aa  77.8  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 
268 aa  77  4e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
257 aa  76.6  5e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
265 aa  75.9  8e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 
255 aa  75.1  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 
255 aa  75.1  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  31.58 
 
 
673 aa  75.1  1e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
255 aa  74.3  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
243 aa  73.6  4e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
269 aa  73.2  5e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.66 
 
 
288 aa  73.2  5e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 
265 aa  73.2  5e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
263 aa  72.8  6e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
263 aa  72.8  6e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.33 
 
 
255 aa  72.8  7e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
231 aa  72.4  8e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
258 aa  72.4  9e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.28 
 
 
250 aa  72  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
278 aa  71.6  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 
370 aa  70.9  2e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 
250 aa  70.9  3e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 
249 aa  70.5  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 
301 aa  69.3  6e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 
243 aa  68.2  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
261 aa  68.6  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
261 aa  67.8  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.06 
 
 
235 aa  67.8  2e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
249 aa  67.8  2e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.14 
 
 
371 aa  67.8  2e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
634 aa  67.8  2e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 
232 aa  67.8  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
282 aa  67  3e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
228 aa  67  4e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
248 aa  66.6  4e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 
278 aa  65.1  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
233 aa  65.1  1e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
257 aa  65.5  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  28.03 
 
 
281 aa  64.7  2e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.21 
 
 
269 aa  64.3  2e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 
269 aa  64.3  2e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.18 
 
 
279 aa  63.9  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  29.62 
 
 
244 aa  62.8  6e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
243 aa  63.2  6e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.05 
 
 
371 aa  62.8  7e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
246 aa  62.4  9e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
264 aa  62.4  9e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
297 aa  62.4  9e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
253 aa  61.2  2e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
258 aa  61.6  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
235 aa  59.7  5e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 
260 aa  59.7  5e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
252 aa  60.1  5e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  29.95 
 
 
286 aa  59.3  6e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.2 
 
 
251 aa  59.3  7e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 
255 aa  58.9  9e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 
255 aa  58.9  9e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  24.56 
 
 
310 aa  58.9  1e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
263 aa  58.5  1e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.55 
 
 
284 aa  58.5  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
257 aa  58.2  2e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
252 aa  57.8  2e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>