More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 435 aa  884    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  50.46 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  50.34 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  48.48 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  46.97 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  46.79 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  48.39 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  42.96 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  39.44 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 420 aa  239  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 495 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.51 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 424 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  26.36 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 434 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.62 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 443 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.77 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.68 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 468 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 420 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 419 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.01 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 448 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 631 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  25.65 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.76 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.05 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.75 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.74 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  22.67 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>