148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  100 
 
 		 635 aa  1243    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  40.19 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 566 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 559 aa  242  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  32.32 
 
 		 591 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 595 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  32.86 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 568 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 571 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 575 aa  207  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.55 
 
 		 566 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 573 aa  206  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  33.67 
 
 		 578 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  34.04 
 
 		 573 aa  203  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  31.75 
 
 		 549 aa  196  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  34.9 
 
 		 573 aa  194  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 592 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  30.62 
 
 		 577 aa  170  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  33.4 
 
 		 536 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 631 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 535 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 409 aa  124  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  31.27 
 
 		 391 aa  118  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  31.44 
 
 		 401 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 372 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  28.29 
 
 		 673 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  27.86 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2079  sigma-54 dependent transcriptional regulator, putative  22.97 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  28.63 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.63 
 
 		 1004 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.38 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  23.12 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  25.94 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 958 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  23.4 
 
 		 523 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  25.32 
 
 		 828 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  22.49 
 
 		 692 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  30 
 
 		 529 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 602 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 703 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  24.37 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 365 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 703 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 		 710 aa  54.7  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 393 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 718 aa  54.3  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 372 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  29.84 
 
 		 372 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  24 
 
 		 372 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.32 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 372 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 402 aa  53.9  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 372 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.98 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 365 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 665 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1527 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 1527 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 377 aa  52.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29 
 
 		 1017 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 425 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 1519 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  26.92 
 
 		 717 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 545 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 372 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  25.77 
 
 		 516 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  22.38 
 
 		 370 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>