37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  43.9 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  42.65 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  45.05 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  38.85 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  43.8 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  40.15 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  36.15 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  37.87 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  37.85 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  38.87 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  49.34 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  35.62 
 
 		 158 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  40.18 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.79 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  37.68 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  34.58 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  40.4 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  40.28 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  27.78 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  40.35 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  33.59 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  34.83 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  26.14 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  26.03 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  33.82 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  33.68 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0824  hypothetical protein  38.32 
 
 		 117 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  34.51 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  32.84 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  28.87 
 
 		 486 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  24.18 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  33.04 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  33.04 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  27.49 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>