More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  100 
 
 		 543 aa  1063    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 566 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 578 aa  330  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  38.76 
 
 		 591 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  39.34 
 
 		 572 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 567 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.58 
 
 		 566 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 595 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 568 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 568 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 573 aa  287  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  39.21 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  36.82 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  40.94 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  38.43 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  37.3 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 579 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  34.66 
 
 		 577 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 580 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 631 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 592 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 565 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  32.89 
 
 		 536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 535 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 571 aa  171  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  34.69 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  34.61 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 409 aa  156  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  39.15 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 372 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  35.78 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  33.71 
 
 		 851 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  31.86 
 
 		 828 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  35.65 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  27.4 
 
 		 673 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 570 aa  82  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 545 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 545 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  26.85 
 
 		 373 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 725 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  30.77 
 
 		 1013 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  33.19 
 
 		 687 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  24.81 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  26.34 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  24.05 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  24.31 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.5 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.58 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  29.85 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.69 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.69 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.69 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.51 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.69 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.4 
 
 		 598 aa  73.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.4 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  28.4 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.54 
 
 		 597 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.69 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  31.65 
 
 		 1048 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  27.01 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.4 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>