More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  100 
 
 
395 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  65.66 
 
 
399 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  57.39 
 
 
398 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  58.6 
 
 
393 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  55.53 
 
 
394 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.45 
 
 
440 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.5 
 
 
409 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.75 
 
 
412 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  51.54 
 
 
388 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.36 
 
 
386 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  49.49 
 
 
386 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.38 
 
 
416 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.65 
 
 
393 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.89 
 
 
399 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  50 
 
 
407 aa  353  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  50.62 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  49.37 
 
 
414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  49.87 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.87 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  51.24 
 
 
404 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.85 
 
 
395 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  46.63 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.99 
 
 
407 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  47.99 
 
 
422 aa  326  5e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  47.93 
 
 
433 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  42.36 
 
 
403 aa  296  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  41.98 
 
 
429 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  42.47 
 
 
403 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  38.46 
 
 
426 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.75 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.75 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.89 
 
 
406 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  39.71 
 
 
411 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  41.75 
 
 
401 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  37.31 
 
 
396 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  36.25 
 
 
396 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  36.3 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  37.63 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  36.91 
 
 
397 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  36.39 
 
 
396 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  39.85 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  36.91 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  36.63 
 
 
397 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  37.72 
 
 
397 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.76 
 
 
399 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  38.24 
 
 
396 aa  236  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  35.56 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  37.22 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  36.97 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  37.06 
 
 
402 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  38.15 
 
 
402 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  35.68 
 
 
398 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  36.97 
 
 
397 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  36.32 
 
 
402 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  37 
 
 
396 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  36.82 
 
 
402 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  36.82 
 
 
402 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.14 
 
 
393 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  36.75 
 
 
396 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  35.07 
 
 
396 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  35.07 
 
 
396 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  36.72 
 
 
396 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
402 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  36.75 
 
 
396 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  35.07 
 
 
396 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  36.32 
 
 
402 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
402 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  36.57 
 
 
402 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  37.72 
 
 
402 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  39.15 
 
 
395 aa  226  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  36.25 
 
 
396 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  35.73 
 
 
395 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  36.25 
 
 
396 aa  225  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  36.25 
 
 
396 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  35.86 
 
 
396 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.2 
 
 
428 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.57 
 
 
408 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  35.57 
 
 
402 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  36.79 
 
 
411 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  35.52 
 
 
410 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.4 
 
 
402 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  38.1 
 
 
402 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  35.63 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  36.05 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  37.63 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  37.63 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  36.46 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  34.83 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.19 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  37.63 
 
 
392 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  35.61 
 
 
396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  38.02 
 
 
413 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  37.94 
 
 
402 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>