99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  100 
 
 		 333 aa  676    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  73.26 
 
 		 297 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  62.96 
 
 		 277 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  62.96 
 
 		 277 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  62.96 
 
 		 277 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  63.2 
 
 		 304 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  60.42 
 
 		 291 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  61.05 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  56.78 
 
 		 299 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  60.73 
 
 		 320 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  59.14 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  60.15 
 
 		 295 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  58.98 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  54.38 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  58.62 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  59.07 
 
 		 286 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  53.82 
 
 		 302 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  51.89 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  56.32 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  55.81 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  54.74 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  54.09 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  54.23 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  56.18 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  52.03 
 
 		 284 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  55.73 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  49.02 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  53.26 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  51.74 
 
 		 280 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.35 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  34.92 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1019 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.55 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  28.57 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.75 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.56 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  26.91 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  25.28 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  25.37 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.62 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.73 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.5 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28 
 
 		 1052 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 1016 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.21 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  28.2 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  28.22 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  23.77 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  26.78 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.98 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  27.27 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  27.31 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.31 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  31.33 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.62 
 
 		 1048 aa  56.6  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  23.16 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.9 
 
 		 958 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1066 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  27.46 
 
 		 1106 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  26.05 
 
 		 997 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  25.98 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  27.23 
 
 		 781 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 		 1094 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  24.15 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  28.57 
 
 		 783 aa  50.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.6 
 
 		 781 aa  49.7  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  26.74 
 
 		 997 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1048 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.81 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  24.23 
 
 		 915 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 1129 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 1099 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  26.07 
 
 		 969 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  22.61 
 
 		 951 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  26.07 
 
 		 969 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 1176 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  28.08 
 
 		 1000 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  27.43 
 
 		 947 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 1134 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.91 
 
 		 1049 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1061 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 1051 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 1051 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  29.05 
 
 		 968 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 1051 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  29.5 
 
 		 1054 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  26.34 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30 
 
 		 915 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.9 
 
 		 957 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  22.52 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  26.34 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  26.34 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  27.69 
 
 		 951 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  25.09 
 
 		 865 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.44 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  22.61 
 
 		 1124 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  28.76 
 
 		 1062 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  23.26 
 
 		 1059 aa  42.7  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>