60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  233  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  81.42 
 
 
114 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  67.26 
 
 
113 aa  167  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  67.26 
 
 
113 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  69.37 
 
 
112 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  72.57 
 
 
113 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  65.49 
 
 
114 aa  157  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  62.62 
 
 
214 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  62.83 
 
 
114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  61.11 
 
 
116 aa  150  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  63.72 
 
 
114 aa  146  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  72.73 
 
 
111 aa  144  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  61.61 
 
 
129 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  59.29 
 
 
114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  71.74 
 
 
111 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  70.65 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  70.65 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  70.65 
 
 
112 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  70.65 
 
 
111 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  69.64 
 
 
111 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  57.94 
 
 
169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  59.29 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  61.22 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  55.36 
 
 
114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  55.14 
 
 
128 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  63.06 
 
 
117 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  61.18 
 
 
114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  54.63 
 
 
114 aa  113  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  53.15 
 
 
115 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  53.15 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  53.12 
 
 
114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  51.85 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  55.43 
 
 
114 aa  105  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  52.75 
 
 
119 aa  100  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  50.49 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  53.26 
 
 
115 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  51.46 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  47.75 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  38.32 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  37.38 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  36.79 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  34.91 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  35.58 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  35.58 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  37.27 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  34.58 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  34.55 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  39.18 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  35.85 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  34.51 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  34.95 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  33.65 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  36.79 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  34.07 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5598  electron transport protein  36.47 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110517  normal  0.627552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  36.05 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  37.78 
 
 
100 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  33.03 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1832  electron transport protein  32.46 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000966124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>