44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  100 
 
 
109 aa  217  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  69.44 
 
 
110 aa  160  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.59 
 
 
112 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  67.92 
 
 
130 aa  148  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  67.89 
 
 
110 aa  147  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  67.59 
 
 
110 aa  146  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.89 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.19 
 
 
111 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  63.3 
 
 
277 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  63.89 
 
 
112 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  61.11 
 
 
111 aa  134  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.81 
 
 
114 aa  133  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  63.89 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  63.89 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  63.89 
 
 
114 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  54.63 
 
 
117 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  62.96 
 
 
113 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  56.6 
 
 
110 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  52.29 
 
 
110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  55.66 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  51.85 
 
 
111 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  45.19 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  46.15 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  50.55 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  45.54 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  43.69 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  41.3 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40.96 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  37.61 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  42.03 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  30.99 
 
 
219 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  38.81 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  30.93 
 
 
110 aa  43.5  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1033  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.98 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  32.14 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0351  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  33.82 
 
 
117 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.76 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0854  hypothetical protein  32.86 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>