235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  100 
 
 		 447 aa  899    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  53.58 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  47.31 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  42.82 
 
 		 447 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  44.21 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  47.03 
 
 		 482 aa  342  5e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  43.34 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  43.95 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  43.85 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  43.15 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  40.35 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  38.17 
 
 		 429 aa  306  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  40.05 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  38.3 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  40.23 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  38.7 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  36.68 
 
 		 420 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.81 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  39.55 
 
 		 456 aa  259  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  37.78 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.71 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  37.11 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  33.56 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  33.18 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.52 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.09 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.65 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.89 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  34.47 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  31.86 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.7 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.61 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34.17 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.18 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  37.19 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.02 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.68 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.78 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.86 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.73 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.81 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  33.26 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.4 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 445 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.5 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.66 
 
 		 418 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  32.51 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.85 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.48 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.18 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  35.31 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  35.24 
 
 		 393 aa  163  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.38 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.14 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.71 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  31.98 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.46 
 
 		 412 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.33 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  32.57 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.6 
 
 		 426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.7 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.31 
 
 		 391 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  31.26 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.57 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.94 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.1 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.38 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.63 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.77 
 
 		 411 aa  143  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.48 
 
 		 431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.56 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.91 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.04 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.84 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.7 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.96 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.75 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.89 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.3 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.78 
 
 		 431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  26.39 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.89 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.04 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.83 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.27 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.05 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  28.12 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.19 
 
 		 438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.84 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.47 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.88 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.73 
 
 		 421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.57 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  28.25 
 
 		 480 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>