More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21260  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 157 aa  309  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.570442  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2661  ferric uptake regulator family protein  48.53 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.946961  normal  0.0414019 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2058  ferric uptake regulator, Fur family  34.93 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6836  ferric uptake regulator, Fur family  43.08 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 		 143 aa  90.9  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  34.69 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0918  ferric uptake regulator  40.6 
 
 		 137 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0061  FUR family nickel uptake regulator  38.64 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0473  Fur family ferric uptake regulator  39.42 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8242  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0199  ferric uptake regulator, Fur family  37.01 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.18921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  30.5 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.56 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  38.24 
 
 		 143 aa  84  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  27.59 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  28.77 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  37.01 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.07 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0391  FUR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  30.07 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  30.07 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  31.47 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.07 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.07 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  33.85 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0896  ferric uptake regulator, Fur family  27.95 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0352  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6149  ferric uptake regulator family protein  42.96 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0654  ferric uptake regulator, Fur family  40.6 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.77 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30.77 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0314  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0295931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  32.82 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.7 
 
 		 150 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1573  ferric uptake regulator, Fur family  28.86 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.99 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0584  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.274905  normal  0.220198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  31.51 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4626  ferric uptake regulator, Fur family  41.01 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  36.22 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  36.18 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0020  FUR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  30.07 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.28 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  31.51 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  31.51 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30.56 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30.56 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  26.76 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30.56 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  31.51 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  29.37 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  34.07 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1006  ferric uptake regulator, Fur family  29.71 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  34.56 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2005  ferric uptake regulator, Fur family  23.85 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.34 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.34 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  28.47 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2798  Fe2+/Zn2+ uptake regulation proteins  31.54 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.1309500000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  30.82 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  25.52 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  28.47 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  28.57 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3251  ferric uptake regulator family protein  31.65 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1474  ferric uptake regulator family protein  31.13 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  31.78 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1415  ferric uptake regulator family protein  32.09 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1230  FUR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0757057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_19  transcriptional regulator, Fur family  31.5 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.677591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  29.63 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1224  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>