103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  100 
 
 
403 aa  832  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  57.75 
 
 
439 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.57 
 
 
628 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.59 
 
 
626 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.03 
 
 
428 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  52.8 
 
 
606 aa  362  7e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  45.52 
 
 
632 aa  328  1e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.52 
 
 
378 aa  166  6e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.29 
 
 
1034 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.11 
 
 
1034 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.13 
 
 
446 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.79 
 
 
773 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.23 
 
 
1061 aa  148  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.31 
 
 
440 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.07 
 
 
432 aa  134  2e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.99 
 
 
1074 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  29.2 
 
 
586 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.83 
 
 
889 aa  116  7e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.66 
 
 
429 aa  116  8e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  4.27177e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.77 
 
 
356 aa  111  2e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4758  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.43 
 
 
824 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.51 
 
 
379 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  24.5 
 
 
502 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  29.53 
 
 
507 aa  82.4  1e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.62 
 
 
406 aa  80.5  5e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.55 
 
 
563 aa  77.8  3e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  1.96465e-06 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  38.05 
 
 
557 aa  77  5e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  27.53 
 
 
815 aa  75.1  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.84 
 
 
557 aa  73.2  7e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.27 
 
 
563 aa  72  2e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.23 
 
 
559 aa  67.4  4e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.91 
 
 
568 aa  67.4  5e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.55 
 
 
553 aa  66.6  7e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.18 
 
 
457 aa  66.2  1e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  24.64 
 
 
821 aa  66.2  1e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.11 
 
 
414 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.11 
 
 
414 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.11 
 
 
414 aa  64.7  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.73 
 
 
561 aa  64.3  4e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 
558 aa  63.9  4e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  23.76 
 
 
423 aa  60.1  8e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.41 
 
 
380 aa  57.8  3e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.89 
 
 
380 aa  56.2  9e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.61 
 
 
361 aa  56.2  9e-07  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.97 
 
 
375 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.2 
 
 
378 aa  53.9  5e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.57 
 
 
383 aa  53.5  6e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.95 
 
 
379 aa  52  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.4 
 
 
262 aa  50.4  5e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  25.18 
 
 
400 aa  50.1  7e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.09 
 
 
375 aa  50.1  7e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.35 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.67 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.35 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.35 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  22.61 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.68 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  24.67 
 
 
384 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  25 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  31.82 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.35 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.46 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  27.54 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.14112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  25.27 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  25 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  24.14 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  24.14 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  24.14 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.5 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  24.14 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.14 
 
 
619 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.5 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  24.14 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.76 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.95 
 
 
383 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.42 
 
 
393 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.35 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.87 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.9 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.32 
 
 
374 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.17 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.27 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.21 
 
 
573 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.27 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  29.2 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  22.33 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.6 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.27 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.27 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.6 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.36 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  22.41 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.1 
 
 
344 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 
384 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.27 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  29.7 
 
 
452 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.42 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.32 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.55 
 
 
376 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>