223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 		 398 aa  786    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  65.14 
 
 		 625 aa  523  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  64.29 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  57.58 
 
 		 403 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  54.91 
 
 		 403 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  59.52 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  54.15 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  54.26 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  53.46 
 
 		 399 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  52.17 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  51.08 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  43.08 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  45.62 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  52.01 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  42.82 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  43.7 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.03 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 407 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  51.19 
 
 		 395 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  43.48 
 
 		 410 aa  339  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  43.48 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  43.81 
 
 		 404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.66 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  41.9 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  41.24 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  39.47 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  41.49 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  45.76 
 
 		 398 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  46.92 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  48.17 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  39.9 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  39.89 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  41.88 
 
 		 416 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  44.3 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  44.85 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  41.97 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  41.97 
 
 		 416 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  40.53 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  38.95 
 
 		 410 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  38.42 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  39.11 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  39.11 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 422 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  37.63 
 
 		 416 aa  292  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  40.84 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  38.85 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  38.85 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  37.91 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  39.11 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  38.85 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  38.85 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  38.06 
 
 		 422 aa  285  8e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  39.69 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  39.43 
 
 		 422 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  39.16 
 
 		 422 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  39.16 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  39.43 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  44.68 
 
 		 245 aa  209  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.96 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  33.75 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.83 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.58 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.58 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.58 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.58 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.99 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  31.67 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  29.14 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 363 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>