50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20840  aryl carrier domain protein  100 
 
 		 95 aa  191  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.630177  decreased coverage  0.00638863 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1868  isochorismatase  47.3 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  44.87 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3062  phosphopantetheine-binding  38.64 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  42.11 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3692  phosphopantetheine-binding protein  45.71 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  41.18 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  40.51 
 
 		 1678 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  44.78 
 
 		 1149 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  46.97 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  40.66 
 
 		 1414 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  37.65 
 
 		 1167 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 		 1167 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  37.65 
 
 		 1167 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  44.62 
 
 		 1152 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  39.44 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 		 640 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  46.15 
 
 		 291 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  35.21 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  38.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  34.67 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  34.67 
 
 		 295 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  34.67 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  38.03 
 
 		 297 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  38.03 
 
 		 297 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  35.21 
 
 		 295 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  40 
 
 		 291 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  35.21 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  42.86 
 
 		 327 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  35.21 
 
 		 2350 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2273  phosphopantetheine-binding  45.45 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.33 
 
 		 1438 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  36.11 
 
 		 2230 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2945  phosphopantetheine-binding  38.67 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0530278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  36.62 
 
 		 1131 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  36.78 
 
 		 2258 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  32 
 
 		 2057 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  41.18 
 
 		 1436 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  36.9 
 
 		 1174 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3616  phosphopantetheine-binding  41.27 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  45.65 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  46.81 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  34.85 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  40.62 
 
 		 294 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  48.78 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.38 
 
 		 319 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  36.11 
 
 		 264 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  45.83 
 
 		 284 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  39.34 
 
 		 2174 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  38.1 
 
 		 1163 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>