More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  77 
 
 		 442 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  74.82 
 
 		 420 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  76.17 
 
 		 447 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  75.43 
 
 		 423 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  72.45 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  74.09 
 
 		 422 aa  594  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  70.39 
 
 		 445 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  70.63 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  72.22 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  70.39 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  70.29 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 452 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  70.12 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  68.84 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  69.9 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  68.12 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 		 430 aa  561  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  68.04 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 		 474 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  73.43 
 
 		 421 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 440 aa  541  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  67.72 
 
 		 422 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 		 434 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.14 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 418 aa  502  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.14 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.25 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 427 aa  494  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 416 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 411 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 412 aa  491  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 414 aa  484  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 420 aa  481  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.39 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.16 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  56.65 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 412 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 410 aa  479  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 424 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.11 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 		 419 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>