58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18560  predicted pyrophosphatase  100 
 
 
120 aa  240  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254127  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0200  hypothetical protein  59.32 
 
 
129 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1669  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  60.53 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0679  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  50 
 
 
127 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.511442  hitchhiker  0.0000132281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0014  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  49.58 
 
 
126 aa  124  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00301608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4465  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  59.26 
 
 
131 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2084  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  57.14 
 
 
120 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.311505  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1298  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  58.04 
 
 
120 aa  120  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1530  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  57.14 
 
 
123 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0591  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  55.05 
 
 
116 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4851  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  57.84 
 
 
117 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.563845  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1343  hypothetical protein  55.05 
 
 
112 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0280  hypothetical protein  56.25 
 
 
131 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4182  hypothetical protein  54.81 
 
 
122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1125  hypothetical protein  51.85 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.874938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0582  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  59.22 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0603  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  59.22 
 
 
104 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.963976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7171  hypothetical protein  50.89 
 
 
123 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1735  hypothetical protein  52.17 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.303631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2074  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  50 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0029  hypothetical protein  52.34 
 
 
110 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1237  hypothetical protein  46.85 
 
 
125 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1357  hypothetical protein  43.75 
 
 
118 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1078  hypothetical protein  52.88 
 
 
118 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3445  hypothetical protein  49.51 
 
 
104 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0013  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.995444  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1293  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  42.11 
 
 
109 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.131741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4014  hypothetical protein  53.85 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2453  hypothetical protein  48.6 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0928  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
110 aa  94  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.0000193078  unclonable  0.00000000000231926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3228  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  44.95 
 
 
115 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.491716  normal  0.0212378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2385  hypothetical protein  47.37 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0167763  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3441  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  41.44 
 
 
110 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3518  hypothetical protein  41.44 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000729179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3800  hypothetical protein  41.44 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0253  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  48.89 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2737  hypothetical protein  41.38 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411617  normal  0.738085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0553  putative pyrophosphatase  40.74 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0741  hypothetical protein  42.57 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5511  hypothetical protein  42.57 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63300  hypothetical protein  41.58 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0819333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1513  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0642  hypothetical protein  41.58 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0632  hypothetical protein  47.22 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0741  hypothetical protein  40.59 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19640  predicted pyrophosphatase  40 
 
 
106 aa  67  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0624  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0579  hypothetical protein  44.44 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0618  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121105  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4585  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.744837  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07270  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1858  mannonate dehydratase  35.29 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.401436  normal  0.311275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2244  hypothetical protein  29.41 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000059482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2161  putative cytoplasmic protein  41.67 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0041  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34.29 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2459  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  35.53 
 
 
107 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130855  hitchhiker  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1054  pyrophosphatase  29.9 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458179  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>