More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
577 aa  1169    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  37.91 
 
 
2997 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  37.79 
 
 
2791 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.89 
 
 
609 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.73 
 
 
1656 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  37.77 
 
 
610 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  37.59 
 
 
599 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  37.23 
 
 
610 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
610 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
599 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
599 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.84 
 
 
2762 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
586 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.32 
 
 
1067 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.92 
 
 
1474 aa  321  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.38 
 
 
2103 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
725 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
725 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  38.13 
 
 
2721 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.56 
 
 
4332 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 
596 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
1272 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.7 
 
 
3235 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
578 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.89 
 
 
4336 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.41 
 
 
4317 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
597 aa  302  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
595 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 
555 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.8 
 
 
3208 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.47 
 
 
1981 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.26 
 
 
4336 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
597 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
597 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.14 
 
 
4317 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.84 
 
 
4342 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.88 
 
 
2820 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  36.47 
 
 
4317 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
577 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
593 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
599 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.81 
 
 
4342 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  33.45 
 
 
583 aa  289  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  33.28 
 
 
576 aa  289  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.92 
 
 
1776 aa  289  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 
991 aa  289  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  33.68 
 
 
619 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
592 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  35.49 
 
 
606 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  34.66 
 
 
2250 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  38.32 
 
 
3231 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  33.92 
 
 
574 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.17 
 
 
6403 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  33.04 
 
 
588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.27 
 
 
1779 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.7 
 
 
1801 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.23 
 
 
4165 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
590 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
590 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
608 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  34.78 
 
 
590 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.63 
 
 
4318 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  34.76 
 
 
580 aa  279  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 
584 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  35.13 
 
 
617 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.56 
 
 
4317 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  35.13 
 
 
617 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  34.57 
 
 
1276 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
1292 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
631 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  34.57 
 
 
1283 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  34.57 
 
 
1291 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  34.77 
 
 
617 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
580 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
605 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 
601 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 
601 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 
1789 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 
601 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.74 
 
 
581 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  35.2 
 
 
626 aa  276  8e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 
582 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
701 aa  276  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  35.06 
 
 
1005 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  34.59 
 
 
592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  35.06 
 
 
605 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 
629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.92 
 
 
1753 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.24 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  33.82 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
551 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
706 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 
629 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  34.16 
 
 
1323 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 
636 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.94 
 
 
559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>