139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  100 
 
 
250 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  60.91 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  59.34 
 
 
248 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  57.72 
 
 
243 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  59.34 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  59.02 
 
 
245 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  54.73 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  50.63 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  47.74 
 
 
246 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  56.97 
 
 
248 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  51.22 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  42.62 
 
 
249 aa  180  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  49.58 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  50.8 
 
 
242 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  41.46 
 
 
252 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  50.8 
 
 
242 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  53.06 
 
 
244 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  49.6 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  48.79 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  46.67 
 
 
249 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  49.4 
 
 
250 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  46.09 
 
 
245 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  49.32 
 
 
251 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  48.37 
 
 
253 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  43.57 
 
 
249 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  44.86 
 
 
259 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  43.53 
 
 
251 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  45.27 
 
 
253 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  45.61 
 
 
259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  40.91 
 
 
248 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  48.52 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  44.63 
 
 
250 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  40.66 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  40.66 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  43.31 
 
 
273 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  42.15 
 
 
255 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  40.32 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  42.52 
 
 
273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  39.6 
 
 
253 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  43.69 
 
 
229 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  42.44 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  35.36 
 
 
262 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  43.72 
 
 
271 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  42.02 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  41.04 
 
 
266 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  46.26 
 
 
243 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  46.26 
 
 
243 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  41.46 
 
 
265 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  41.2 
 
 
253 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  44.44 
 
 
250 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  42.22 
 
 
239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  42 
 
 
253 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  41.7 
 
 
247 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  40.27 
 
 
239 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  45.42 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  40.87 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  41.59 
 
 
239 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  42.59 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  46.7 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  44.26 
 
 
268 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  41.88 
 
 
242 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  39.64 
 
 
242 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  39.92 
 
 
239 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  38.05 
 
 
246 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  47.56 
 
 
256 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  41.49 
 
 
239 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  37.61 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  40.17 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  44.31 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  42.67 
 
 
242 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  41.96 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  40.59 
 
 
242 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  46.43 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  41.78 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  45.98 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  41.25 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  46.9 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  40.36 
 
 
256 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  46.05 
 
 
243 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  45.81 
 
 
243 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  45.58 
 
 
246 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  41.37 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  37.82 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  30.74 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  28.57 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  32.19 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  26.42 
 
 
655 aa  82  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  29.31 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  30.71 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  26.61 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  26.61 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  25.62 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  28.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  30.71 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  30.31 
 
 
263 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>