236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  47.74 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  51.31 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  44.68 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  45.11 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  45.11 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  45.11 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  45.11 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.11 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.68 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  44.32 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  45.65 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  44.57 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  44.02 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  51.26 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  47.09 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  41.79 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  41.3 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  39.25 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.68 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.96 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  43.3 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  46.88 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  43.63 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  36.27 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  35.03 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  48.59 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  46.6 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  40.66 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  47.4 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  41.62 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  36.51 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  43.9 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  48.54 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  33.5 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  40.11 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  51.32 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.83 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.16 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  46.51 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  41.32 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  35.55 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  35.55 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  43.79 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  37.02 
 
 		 195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.7 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  38.55 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.71 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  35.75 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  44.44 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2867  hypothetical protein  35.6 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.81 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  37.97 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.67 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  37.22 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.1 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  32.7 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  36.7 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  32.26 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  37.42 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01194  thymidylate synthase  42.76 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.43796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  36.93 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  38.2 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  36.47 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  40.35 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  36.07 
 
 		 290 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  36.99 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  36.99 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.46 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  41.25 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  35.91 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  39.77 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  39.43 
 
 		 274 aa  104  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  39.23 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  36.48 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  33.54 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  36.48 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  36.48 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  38.02 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  34.5 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  38.1 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  36.21 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  34.64 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  34.46 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  36.81 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  45.16 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  35.2 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.42 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  35.47 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  32.96 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>