More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16830  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
559 aa  1108    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.753908  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6521  serine/threonine protein kinase  44.06 
 
 
553 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  60.22 
 
 
509 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04840  protein kinase family protein  61.85 
 
 
575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6520  serine/threonine protein kinase  56.76 
 
 
466 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3766  serine/threonine protein kinase  39.97 
 
 
571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  39.93 
 
 
554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  57.59 
 
 
855 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0916  serine/threonine protein kinase  46.19 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1744  Serine/threonine protein kinase-related protein  50.92 
 
 
405 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.679027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  55.88 
 
 
493 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  51.77 
 
 
411 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  39.74 
 
 
563 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2236  serine/threonine protein kinase  48.6 
 
 
632 aa  243  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129729  normal  0.143063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  48.68 
 
 
562 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  50.38 
 
 
528 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6676  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.52 
 
 
678 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520926  normal  0.364825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  45.79 
 
 
468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  46.32 
 
 
776 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  45.49 
 
 
535 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0831  protein kinase  45.35 
 
 
675 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.060355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0775  serine/threonine protein kinase  45.52 
 
 
659 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.37143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.62 
 
 
596 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  46.07 
 
 
695 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1542  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.91 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.79 
 
 
531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  45.61 
 
 
525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 
419 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0682  serine/threonine protein kinase  45.76 
 
 
674 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239095  normal  0.045288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  44.96 
 
 
422 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0798  serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
638 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000182668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  46.3 
 
 
470 aa  217  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  42.49 
 
 
766 aa  217  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0852  protein kinase  47.83 
 
 
621 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6420  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4070  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
673 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00170756  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  36.56 
 
 
501 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 
525 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  44.94 
 
 
631 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  49.52 
 
 
703 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  40.24 
 
 
377 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05660  serine/threonine protein kinase  46.21 
 
 
419 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3969  serine/threonine protein kinase  52.83 
 
 
575 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4798  serine/threonine protein kinase  36.53 
 
 
583 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609018  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.98 
 
 
668 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
418 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2411  serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 
507 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  46.13 
 
 
1029 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
487 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
721 aa  203  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  41.43 
 
 
674 aa  203  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4477  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
581 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.695669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1544  Serine/threonine protein kinase-like protein  44.44 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.372452  normal  0.854726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5937  serine/threonine protein kinase  45.02 
 
 
617 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  46.19 
 
 
595 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6454  serine/threonine protein kinase  46.03 
 
 
705 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00864828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  43.82 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.48 
 
 
446 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
460 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
646 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1978  protein kinase  44.03 
 
 
482 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1316  serine/threonine protein kinase  39.84 
 
 
503 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
776 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.17 
 
 
596 aa  188  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2888  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.56 
 
 
659 aa  187  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.301029  normal  0.670701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6592  serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 
468 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.700225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
673 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0129  serine/threonine protein kinase  44.84 
 
 
345 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  40.94 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  44.76 
 
 
493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04830  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
316 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0435462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.59 
 
 
505 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.25 
 
 
627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  42.7 
 
 
534 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.16 
 
 
650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
316 aa  180  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  44.5 
 
 
612 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  45.21 
 
 
1655 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.93 
 
 
512 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  40.21 
 
 
666 aa  179  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0730  serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 
464 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  38.34 
 
 
564 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  43.98 
 
 
480 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 
503 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.91 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  40.19 
 
 
638 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
568 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.22 
 
 
620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2136  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
660 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701308  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  41.78 
 
 
581 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
499 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 
439 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
599 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3516  serine/threonine protein kinase  46.15 
 
 
481 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0144  serine/threonine protein kinase  41.55 
 
 
650 aa  170  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
641 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  37.21 
 
 
320 aa  169  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  42.19 
 
 
473 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>