57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  55.81 
 
 		 287 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  56.2 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  50.39 
 
 		 275 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  57.71 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  57.71 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  57.71 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  50 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  47.97 
 
 		 279 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  42.69 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  50.69 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  34.78 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  35.62 
 
 		 460 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  29.08 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  26.13 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  30.85 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  28.5 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  29.61 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  29.86 
 
 		 499 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  29.94 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  25.25 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  30.9 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  24.86 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  26.05 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  22.05 
 
 		 565 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  23.9 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  27.59 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  22.87 
 
 		 582 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  29.44 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  27.61 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  29.57 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  29.57 
 
 		 503 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  29.57 
 
 		 503 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  29.57 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  27.62 
 
 		 494 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  31.62 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  28.3 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  29.13 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  29.13 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  21.65 
 
 		 525 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  28.88 
 
 		 487 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  28.36 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  31.3 
 
 		 487 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.35 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  25.29 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  23.23 
 
 		 486 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  28.78 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  28.78 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  29.86 
 
 		 487 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  29.86 
 
 		 487 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  21.78 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  20.89 
 
 		 547 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  31.94 
 
 		 487 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  29.86 
 
 		 487 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>