45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16110 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1044    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  54.17 
 
 		 527 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  44.23 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  42.88 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  42.88 
 
 		 579 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  42.69 
 
 		 579 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  44.66 
 
 		 572 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  42.61 
 
 		 594 aa  356  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  42.38 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  42.14 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2381  hypothetical protein  41.2 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  40.31 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  40.09 
 
 		 557 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  33.91 
 
 		 529 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  34.69 
 
 		 527 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  36.38 
 
 		 516 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  32.8 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  32.8 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  32.8 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  31.62 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000178161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  32.26 
 
 		 518 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0380  hypothetical protein  36.86 
 
 		 522 aa  163  7e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0142204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  37.96 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2667  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.5 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.64 
 
 		 505 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  30.22 
 
 		 546 aa  150  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  35.16 
 
 		 498 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  31.46 
 
 		 490 aa  143  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  29.92 
 
 		 551 aa  137  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0074  putative integral membrane protein  29.29 
 
 		 563 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3578  hypothetical protein  32.1 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.20773  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  31.75 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3333  hypothetical protein  39.38 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.783795  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  33.1 
 
 		 509 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3577  hypothetical protein  37.61 
 
 		 495 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  31.18 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4388  hypothetical protein  27.9 
 
 		 592 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0167388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2915  hypothetical protein  38.3 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.094535  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  37.09 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0185  hypothetical protein  31.86 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.245138  normal  0.905302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  33.09 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  34.23 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  30.07 
 
 		 477 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  34.59 
 
 		 473 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1899  hypothetical protein  28.17 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>