More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 
484 aa  950  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  70.46 
 
 
478 aa  573  1e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  60.96 
 
 
452 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.33 
 
 
462 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.64 
 
 
449 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.79 
 
 
455 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  58.57 
 
 
455 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.57 
 
 
455 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  58.01 
 
 
494 aa  440  1e-122  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  57.37 
 
 
457 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  60.4 
 
 
460 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.46 
 
 
509 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.14 
 
 
465 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.4 
 
 
508 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  52.18 
 
 
476 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  51.16 
 
 
515 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  52.92 
 
 
471 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.26 
 
 
505 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  49.06 
 
 
543 aa  362  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.73 
 
 
472 aa  360  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  48.89 
 
 
539 aa  358  1e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  48.18 
 
 
527 aa  357  2e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39928e-14 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  51.52 
 
 
489 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  51.08 
 
 
517 aa  356  7e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  53.35 
 
 
509 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  52.29 
 
 
480 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  49.59 
 
 
551 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  47.4 
 
 
517 aa  348  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  49.29 
 
 
493 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.71 
 
 
495 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  52.33 
 
 
460 aa  338  1e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  48.98 
 
 
491 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  50.67 
 
 
440 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  48.35 
 
 
486 aa  321  2e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  44.95 
 
 
502 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.5 
 
 
532 aa  269  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.28 
 
 
448 aa  214  3e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  37.88 
 
 
446 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.13 
 
 
448 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.36 
 
 
452 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.83 
 
 
457 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.27 
 
 
448 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.48 
 
 
452 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.05 
 
 
453 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.39 
 
 
451 aa  199  1e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  32.1 
 
 
446 aa  199  1e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.77 
 
 
452 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.04 
 
 
456 aa  197  5e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  30.62 
 
 
443 aa  196  8e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.62 
 
 
443 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  33.76 
 
 
448 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.93 
 
 
442 aa  191  3e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  33.55 
 
 
449 aa  191  3e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.45 
 
 
455 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.9 
 
 
449 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  31.24 
 
 
452 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  32.2 
 
 
462 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  33.33 
 
 
452 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.93 
 
 
442 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.12 
 
 
444 aa  185  1e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  39.39 
 
 
439 aa  185  2e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  28.14 
 
 
449 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.33 
 
 
447 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.4 
 
 
451 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  36.13 
 
 
501 aa  181  3e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  29.79 
 
 
444 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  27.53 
 
 
435 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  32.61 
 
 
453 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.44 
 
 
451 aa  175  2e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  33.12 
 
 
432 aa  174  3e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  29.94 
 
 
444 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  29.68 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  28.48 
 
 
444 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  27.73 
 
 
435 aa  171  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  27.73 
 
 
435 aa  171  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  31.79 
 
 
428 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.87 
 
 
418 aa  170  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.26 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.26 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.26 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.26 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  30.09 
 
 
451 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.26 
 
 
444 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  29.51 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  28.93 
 
 
444 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.72 
 
 
451 aa  167  3e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.45 
 
 
444 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  38.7 
 
 
455 aa  166  1e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  31.55 
 
 
427 aa  164  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  37.5 
 
 
455 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  30.15 
 
 
429 aa  164  4e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  38.26 
 
 
455 aa  164  5e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.84 
 
 
464 aa  164  5e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  30.15 
 
 
429 aa  164  5e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  30.15 
 
 
429 aa  164  5e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  34.49 
 
 
473 aa  163  5e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  30.15 
 
 
429 aa  164  5e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  30.15 
 
 
429 aa  164  5e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  30.15 
 
 
429 aa  164  5e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  30.37 
 
 
429 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>