More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 875 aa  671    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 904 aa  973    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 892 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 867 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 891 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 884 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 905 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 883 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 875 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 874 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 880 aa  706    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 892 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 867 aa  644    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 883 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 860 aa  653    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 860 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 874 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 889 aa  999    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 878 aa  727    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 874 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 892 aa  973    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 913 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 875 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 882 aa  739    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 897 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 876 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 880 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 864 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 893 aa  898    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 886 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 886 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 877 aa  668    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 876 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 881 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 874 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 905 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 881 aa  921    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 891 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 874 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 874 aa  636    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 931 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 875 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 876 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 892 aa  978    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 874 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 876 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 868 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 889 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 896 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 884 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 863 aa  647    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 902 aa  639    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 886 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 897 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 897 aa  959    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 865 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 887 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 879 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 879 aa  636    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 874 aa  673    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 863 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 874 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 874 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 869 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 874 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 880 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0533  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 884 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000106893  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 874 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 880 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 882 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 		 892 aa  888    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 897 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 885 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 878 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 874 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 886 aa  921    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 878 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 885 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 896 aa  933    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 900 aa  643    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 897 aa  959    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 898 aa  953    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 876 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 879 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 898 aa  978    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 892 aa  926    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 		 897 aa  957    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>