58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  100 
 
 
397 aa  766    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  59.32 
 
 
513 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  50.15 
 
 
599 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  47.01 
 
 
436 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  47.87 
 
 
449 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  47.07 
 
 
448 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  38.8 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  38.81 
 
 
428 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  40.3 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  38.74 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  35.73 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  35.1 
 
 
499 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  40.37 
 
 
427 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  44.66 
 
 
484 aa  209  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  38.25 
 
 
563 aa  202  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  39 
 
 
413 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  42.07 
 
 
447 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  39.65 
 
 
424 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  39.65 
 
 
424 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  40.31 
 
 
410 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  41.82 
 
 
416 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  39.56 
 
 
404 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  44.53 
 
 
438 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  38.89 
 
 
480 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  40.61 
 
 
404 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  42.02 
 
 
446 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  37.76 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  34.9 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  42.25 
 
 
386 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  28.66 
 
 
393 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  32.16 
 
 
392 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  32.19 
 
 
409 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  31.93 
 
 
451 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  33.46 
 
 
373 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  31.4 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  28.65 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.62 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  31.76 
 
 
370 aa  125  9e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  32.05 
 
 
404 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  34.6 
 
 
376 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  29.3 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  28.26 
 
 
416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  27.75 
 
 
396 aa  99.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  28.53 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  25.25 
 
 
260 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  25.25 
 
 
260 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.64 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  25.1 
 
 
261 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  26.6 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  26.6 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  26.04 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  29.14 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  21.94 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  25.11 
 
 
253 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  25.86 
 
 
361 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  22.32 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  22.02 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  22.46 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>