89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  37.63 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  37.72 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  39.93 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  35.31 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  37.41 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  36.33 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  36.79 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  36 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  36.82 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  32.84 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  32.5 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  35.99 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  35.51 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  35 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  32.01 
 
 		 283 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  24.91 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  28.11 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  25.27 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.73 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  26.57 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  25.7 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  25.9 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  25.88 
 
 		 288 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  27.11 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  25.98 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  22.47 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  25.98 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2876  aminotransferase, class IV  23.98 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  27.9 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  21.56 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  23.98 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  20.33 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  24.24 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  24.1 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  22.14 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  23.69 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  31.07 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  29.5 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  27.45 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1665  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.908145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  23.88 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  28.16 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  28.4 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  28.4 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.26 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  24.06 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  28.4 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  22.09 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  29.13 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  23.65 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  27.43 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  27.6 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  26.87 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  22.98 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  20.99 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  26.11 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1830  peptidase  29.55 
 
 		 663 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.932627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  24.88 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  21.46 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  27.49 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.63 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.0975839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.76 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.76 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  23.48 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.76 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.76 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  26.67 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  20.43 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  23.32 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3362  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  27.49 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  23.56 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  20.99 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  28.35 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  20.99 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.51 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  21.98 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  30.3 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  25.74 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  25.55 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  32.11 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.81 
 
 		 271 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  25.98 
 
 		 296 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>