287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  64.33 
 
 		 174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  48.98 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  47.37 
 
 		 205 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  48.61 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  46.45 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  46.45 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  44.74 
 
 		 175 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  54.2 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  43.42 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  43.59 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  41.38 
 
 		 176 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  47.17 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  46.53 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  42.76 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  39.87 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  40.26 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  40.26 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  39.18 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  40.26 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  35.4 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  34.76 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  45.21 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  41.18 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  42.13 
 
 		 308 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  41.36 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  38.85 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  41.04 
 
 		 268 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  34.93 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  41.92 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  33.57 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  35.62 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  34.69 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  44.12 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  32.93 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  39.04 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.17 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  34.23 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  29.77 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.19 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  36 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  35.93 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  32.05 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  32.68 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  38.52 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  31.29 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  29.94 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  43.2 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  34.88 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  30.34 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  39.56 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  34.11 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  32.87 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.45 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  31.21 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  31.54 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  24.49 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  32.68 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.58 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  29.37 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  34.03 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  28.97 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  30.57 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>