More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 139 aa  273  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  76.34 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  60.9 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  65.52 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  70.1 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  67.42 
 
 		 103 aa  124  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  66.29 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  70.37 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  63.44 
 
 		 164 aa  116  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  38.71 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  35.48 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  35.48 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  32.26 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  52.46 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  49.23 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  39.74 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  32.26 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  32.91 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  39.67 
 
 		 227 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0649  transcriptional regulator, ArsR family  49.32 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  37.21 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  34.91 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  31.78 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0526  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  41.75 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  50.68 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0052  transcriptional regulator, ArsR family  44.58 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.135929  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  36.17 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>