More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 142 aa  293  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  73.33 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  68.29 
 
 		 131 aa  183  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  63.36 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  63.36 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  63.36 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  65.6 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  61.42 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  60.94 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  62.5 
 
 		 167 aa  167  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  64.57 
 
 		 150 aa  166  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  60.16 
 
 		 133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  58.09 
 
 		 175 aa  159  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  56.45 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  59.52 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  60.48 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  62.1 
 
 		 187 aa  156  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  57.66 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  56.59 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  62.88 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 136 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  60.48 
 
 		 150 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  57.26 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  58.2 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  57.6 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  58.87 
 
 		 142 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  55.47 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  58.33 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  51.56 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  51.56 
 
 		 154 aa  139  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  48.84 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  49.19 
 
 		 129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  50.41 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  48.06 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  45.67 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  38.1 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.97 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  32.61 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.29 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  38.4 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.8 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  34.11 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  37.6 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  35.71 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  30 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  30 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  30 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  34.43 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  36.67 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4742  ferric uptake regulator, Fur family  39.06 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1577  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  32.64 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.92 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  32.03 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.06 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  33.07 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  34.68 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  28.68 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  32.52 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32.26 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32.26 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  32.26 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.27 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  34.13 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  33.8 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  31.25 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  33.83 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  32.03 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  32.88 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>