More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  100 
 
 
183 aa  363  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  78.86 
 
 
187 aa  280  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  65.09 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  65.09 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  65.09 
 
 
177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  63.31 
 
 
184 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  63.91 
 
 
178 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  65.68 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  61.75 
 
 
186 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  62.01 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  57.95 
 
 
188 aa  197  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  66.45 
 
 
157 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  64.24 
 
 
164 aa  191  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  63.82 
 
 
170 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  62.91 
 
 
153 aa  184  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  58.17 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  59.46 
 
 
150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  59.06 
 
 
167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  59.73 
 
 
153 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  57.05 
 
 
160 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  57.24 
 
 
156 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  56.58 
 
 
155 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  58.28 
 
 
156 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  56.77 
 
 
159 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  60.81 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  56.08 
 
 
151 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  56.25 
 
 
162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  56.67 
 
 
159 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  54.61 
 
 
173 aa  167  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  57.43 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  53.21 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  54.05 
 
 
166 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  54.36 
 
 
149 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  53.33 
 
 
201 aa  154  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  48.65 
 
 
186 aa  150  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  53.02 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  48.65 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  52.03 
 
 
157 aa  125  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  45.95 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.28 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  47.06 
 
 
446 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  42.98 
 
 
156 aa  85.5  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  34 
 
 
155 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.77 
 
 
142 aa  84.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  37.41 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.35 
 
 
156 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  36.84 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  41.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.35 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  35.48 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  39.29 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  39.87 
 
 
301 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  35.43 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  32.9 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  38.94 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  34.68 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.23 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.21 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.61 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0750  protein of unknown function UPF0054  40.71 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.698652  hitchhiker  0.000447843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  42.45 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  34.29 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0598  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.71 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  36.89 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  34.69 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  37.3 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  34.46 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  34.46 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  36.94 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  39.67 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  38.02 
 
 
131 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  31.94 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.87 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  30.97 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  30.88 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  35.71 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  43.18 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  35.67 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  33.81 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  31.68 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  37.74 
 
 
411 aa  68.2  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  28.12 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  38.26 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  36.51 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  34.46 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  32.46 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  35.96 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  44.19 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>