231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  100 
 
 		 569 aa  1152    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  61.82 
 
 		 657 aa  681    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  61.9 
 
 		 563 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  60.45 
 
 		 622 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.74 
 
 		 586 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.31 
 
 		 593 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  63.19 
 
 		 562 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  61.43 
 
 		 578 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  61.46 
 
 		 591 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  67.08 
 
 		 557 aa  738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  62.39 
 
 		 564 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  65.02 
 
 		 570 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  61.46 
 
 		 591 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  60.21 
 
 		 578 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  63.54 
 
 		 577 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  61.46 
 
 		 591 aa  688    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  61.11 
 
 		 578 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  62.52 
 
 		 563 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  60.39 
 
 		 567 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.47 
 
 		 583 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  59.86 
 
 		 581 aa  623  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  63.88 
 
 		 556 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.53 
 
 		 623 aa  617  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  56.94 
 
 		 577 aa  615  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 		 587 aa  607  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.74 
 
 		 582 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.48 
 
 		 562 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.84 
 
 		 567 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.53 
 
 		 565 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.19 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  47.2 
 
 		 540 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.51 
 
 		 543 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.51 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  42.47 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  42.47 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  42.47 
 
 		 653 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  42.47 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  43.26 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  42.47 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  42.47 
 
 		 632 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 696 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.98 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.32 
 
 		 786 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 572 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 889 aa  173  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  32.86 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 		 1150 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1150 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 1132 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  28.17 
 
 		 551 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.7 
 
 		 1152 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1152 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  28.76 
 
 		 554 aa  100  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.3 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  32.01 
 
 		 513 aa  97.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.3 
 
 		 526 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 		 527 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  33.33 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  26.86 
 
 		 543 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  28.53 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 556 aa  85.1  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.91 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  31.76 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  25.27 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.43 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  29.2 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.91 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.91 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  25.42 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.75 
 
 		 553 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  24.72 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  27.32 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  28.84 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.84 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.2 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.09 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.2 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.29 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  29.67 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.11 
 
 		 470 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.47 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.27 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.54 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.55 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 1146 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.29 
 
 		 539 aa  67  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.5 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.8 
 
 		 511 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  24.86 
 
 		 539 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.47 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.52 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.51 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.54 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>