67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
220 aa  444  1e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  47.73 
 
 
211 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  43.04 
 
 
230 aa  162  4e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 
234 aa  152  3e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  38.77 
 
 
223 aa  133  2e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
235 aa  131  8e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.6 
 
 
224 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
232 aa  120  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  33.9 
 
 
236 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
236 aa  112  4e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  34.11 
 
 
224 aa  110  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 
244 aa  110  2e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
231 aa  110  2e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  33.47 
 
 
236 aa  110  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
236 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
236 aa  108  7e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
229 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
244 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  32.63 
 
 
236 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 
224 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
236 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
288 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
225 aa  101  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 
236 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  30.38 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.91 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  34.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
224 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
224 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  34.96 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
234 aa  89  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  34.7 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  30.74 
 
 
224 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  30.74 
 
 
224 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  30.74 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
236 aa  83.6  2e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
224 aa  83.2  3e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 
225 aa  82.4  5e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
271 aa  80.9  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.7 
 
 
222 aa  79.7  3e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 
224 aa  75.9  5e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
218 aa  70.5  2e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
224 aa  51.6  9e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
209 aa  49.3  5e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  27.88 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
258 aa  45.1  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  29.24 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  23.81 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0362  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
209 aa  42  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  27.43 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>