More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  80.15 
 
 		 447 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  80.86 
 
 		 423 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  77.62 
 
 		 422 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  81.8 
 
 		 420 aa  686    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  76.79 
 
 		 442 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  860    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  76.32 
 
 		 445 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  79.2 
 
 		 453 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  75.84 
 
 		 434 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  74.03 
 
 		 435 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 		 432 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  73.61 
 
 		 428 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  74.03 
 
 		 430 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  76.07 
 
 		 452 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  73.44 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  72.92 
 
 		 422 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  73.51 
 
 		 427 aa  614  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  79 
 
 		 421 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  73.54 
 
 		 432 aa  607  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 		 412 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  71.12 
 
 		 426 aa  607  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  73.06 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  75.78 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  71.88 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  70.71 
 
 		 425 aa  594  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  71.88 
 
 		 426 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 474 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.66 
 
 		 431 aa  511  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 416 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  59.53 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 414 aa  494  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 416 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  58.67 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 414 aa  490  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 423 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 413 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.53 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>