More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  100 
 
 		 370 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  63.16 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  62.88 
 
 		 362 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  58.93 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  60.37 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  59.32 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  61.2 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  58.87 
 
 		 372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  60.93 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  60.5 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  60.88 
 
 		 372 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  54.69 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12380  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.17 
 
 		 377 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0676633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  54.93 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0765  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.82 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.858386  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0537  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  55.2 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  56.16 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  52.6 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  48.23 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  46.37 
 
 		 357 aa  326  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  45.83 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  49.17 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  48.63 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.34 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.86 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.15 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  46.01 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.58 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.37 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.88 
 
 		 364 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.27 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.48 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  44.02 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.31 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  42.27 
 
 		 365 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  41.83 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  43.6 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.97 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.69 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  44.69 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  38.15 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  45 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  41.92 
 
 		 378 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  45.13 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.19 
 
 		 369 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.19 
 
 		 369 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.66 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  42.02 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.66 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.37 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  42.97 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  45.9 
 
 		 372 aa  279  6e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  46.63 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.5 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.58 
 
 		 374 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  39.51 
 
 		 366 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.02 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.41 
 
 		 380 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.69 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.3 
 
 		 403 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  44.17 
 
 		 365 aa  272  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  41.11 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.08 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  41.14 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  45.01 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.28 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1647  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40.16 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  42.74 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  35.97 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.36 
 
 		 363 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  40 
 
 		 360 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  39.73 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.71 
 
 		 372 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  40.72 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.07 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.78 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  42.26 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1559  aminomethyltransferase  42.35 
 
 		 371 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  37.67 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.07 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.94 
 
 		 430 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1905  glycine cleavage system T protein  44.44 
 
 		 374 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.962172  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.39 
 
 		 363 aa  256  7e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  37.53 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.17 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  41.48 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0375  glycine cleavage system T protein  40.06 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  36.84 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  39.34 
 
 		 367 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  39.67 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  39.67 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  39.72 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>