More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 504 aa  1038    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3449  extracellular solute-binding protein family 5  41.36 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.85 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.05 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.05 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.05 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.59 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.65 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.6 
 
 		 524 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  29.92 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.29 
 
 		 545 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30.06 
 
 		 523 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.71 
 
 		 502 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.65 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.68 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 505 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 511 aa  177  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  28.17 
 
 		 533 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  29.53 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.85 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 515 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  29.48 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.24 
 
 		 530 aa  173  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 514 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.7 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 527 aa  170  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 528 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  27.07 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.79 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.25 
 
 		 523 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 528 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.87 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.35 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 526 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.57 
 
 		 526 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 534 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 		 531 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 		 522 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.83 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.83 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 510 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  31.73 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.12 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.68 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.68 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 534 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1036  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 524 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 514 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 515 aa  156  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 531 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 513 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.68 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  27.25 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.42 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.21 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.31 
 
 		 535 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.85 
 
 		 518 aa  154  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1103  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 524 aa  153  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  28.38 
 
 		 531 aa  153  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  28.43 
 
 		 499 aa  153  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  27.05 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 531 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 532 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 531 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>