More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 264 aa  521  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  72.98 
 
 		 261 aa  348  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  68.63 
 
 		 267 aa  331  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  69.8 
 
 		 267 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  64.37 
 
 		 249 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  70 
 
 		 263 aa  298  9e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  59.2 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  52.24 
 
 		 258 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  52.28 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  53.04 
 
 		 278 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  54.89 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 319 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  56.02 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  54.89 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  54.89 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  54.89 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  54.27 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  54.36 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  54.77 
 
 		 263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  53.91 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  61.64 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  54.08 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  52.99 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  51.87 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  50.21 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 601 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  53.57 
 
 		 549 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 277 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  46.48 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  51.07 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  46.91 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  48.29 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  46.91 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  48.29 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  50.2 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  46.37 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  45.38 
 
 		 256 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 277 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  44.98 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  47.2 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  47.37 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0233  transcriptional regulator PcaR  47.76 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3721  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  49.08 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  46.98 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 325 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  47.35 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  45.27 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.23 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  44.86 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  46.89 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  49.77 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  42.62 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.14 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5034  regulatory protein, IclR  41.96 
 
 		 255 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1220  IclR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  42.98 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1648  regulatory proteins, IclR  44.39 
 
 		 270 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  48.63 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1846  IclR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762112  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  41.6 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02912  transcriptional regulator  46.64 
 
 		 223 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20200  transcriptional regulator, IclR family  42.61 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0267  IclR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000958449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3689  transcriptional regulator, IclR family  41.35 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000176782  hitchhiker  0.0000000000718636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>