More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  100 
 
 		 86 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 86 aa  127  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 86 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  72.09 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  75.9 
 
 		 88 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  70.93 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  74.7 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  69.77 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  74.03 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  73.42 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  67.82 
 
 		 86 aa  103  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  63.95 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  74.39 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  66.27 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  61.63 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  64.2 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  63.86 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  61.63 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  66.67 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 162 aa  87.8  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  65.12 
 
 		 88 aa  87  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 89 aa  83.6  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  60.76 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  49.41 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  53.49 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  48.84 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  47.62 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  43.48 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0306  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000167926  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  47.78 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0225  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477404  normal  0.0381808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  45.24 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf244  ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  43.53 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1134  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  43.18 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000542728  normal  0.0144218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0048  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000161385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00000872417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0047  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000090572  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0048  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000398649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3575  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0023  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000255802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0027  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3631  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000506786  normal  0.726814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  48.28 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00026  hypothetical protein  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000313857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0026  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000013085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0022  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000378838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>