More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  62.56 
 
 		 204 aa  241  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  52.07 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  52.07 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  52.07 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  53.92 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  51.87 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  53.49 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  48.04 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.61 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 249 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 198 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 234 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.7 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  39.51 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.14 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.67 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 225 aa  98.6  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 370 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 412 aa  92.8  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  35.62 
 
 		 193 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 378 aa  91.3  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  41.67 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.4 
 
 		 382 aa  89  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 411 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.67 
 
 		 369 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.91 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  35.93 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  39.1 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 449 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.47 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.76 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.69 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.93 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.05 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  37.64 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.96 
 
 		 442 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>