More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  100 
 
 
135 aa  267  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1198  iojap-like protein  73.53 
 
 
148 aa  180  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  73.28 
 
 
120 aa  172  2e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  64.62 
 
 
133 aa  172  2e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  67.52 
 
 
122 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  67.52 
 
 
122 aa  170  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  63.25 
 
 
132 aa  157  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  62.6 
 
 
138 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  62.28 
 
 
130 aa  153  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  64.04 
 
 
127 aa  153  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  62.07 
 
 
141 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  63.25 
 
 
139 aa  151  3e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  65.81 
 
 
134 aa  150  6e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  66.99 
 
 
120 aa  149  9e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  65.55 
 
 
135 aa  149  9e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1509  iojap-like protein  69.57 
 
 
137 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0462296  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  66.36 
 
 
121 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  64.96 
 
 
126 aa  147  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  65.52 
 
 
127 aa  146  1e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  2.01224e-05  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  64.96 
 
 
133 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  67.54 
 
 
144 aa  141  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  58.91 
 
 
129 aa  141  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49501e-13 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  65.52 
 
 
173 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  61.54 
 
 
134 aa  139  1e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  59.35 
 
 
125 aa  139  1e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  59.02 
 
 
151 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  63.79 
 
 
148 aa  134  3e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3473  iojap-like protein  65.52 
 
 
132 aa  132  1e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7260  hypothetical protein  64.35 
 
 
135 aa  132  1e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.00377e-06  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  64.13 
 
 
141 aa  131  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1607  iojap-like protein  65.85 
 
 
191 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3853  iojap-like protein  64.66 
 
 
133 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.782657  hitchhiker  0.00260799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  59.78 
 
 
138 aa  125  2e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1233  Iojap-related protein  66.67 
 
 
196 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.342641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0719  hypothetical protein  52.1 
 
 
137 aa  123  8e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00101649  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0764  iojap-like protein  64.89 
 
 
132 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.589269  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10180  iojap-related protein  56.7 
 
 
141 aa  113  1e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.168082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  54.17 
 
 
118 aa  107  7e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.39024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  44.66 
 
 
118 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.07265e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  49.54 
 
 
142 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  3.65534e-11 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  47.66 
 
 
118 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.2805e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  44.76 
 
 
110 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  45.61 
 
 
144 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  47.62 
 
 
107 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  46.3 
 
 
191 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  53.76 
 
 
150 aa  99  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  44.74 
 
 
144 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1012  iojap-like protein  43.97 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  46.61 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.89548e-09  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  49.47 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  45.13 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.56032e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  44.95 
 
 
144 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  46.85 
 
 
143 aa  95.9  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  2.25979e-08  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  46.94 
 
 
198 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  46.94 
 
 
198 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  45.54 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  41.67 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  6.67428e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  43.52 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  5.88564e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  47.22 
 
 
115 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  42.2 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  40.54 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  42.16 
 
 
112 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  40.18 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  40 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  42.99 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  40.37 
 
 
118 aa  90.5  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  8.07789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  42.48 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  41.35 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  52.13 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  47.71 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  51.06 
 
 
114 aa  89.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  36.7 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  4.45596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13060  iojap-related protein  42 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.691164  normal  0.0908003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  44.94 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  44.23 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  41.96 
 
 
118 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.49181e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  44.76 
 
 
124 aa  87.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  35.78 
 
 
114 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  42 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  40.57 
 
 
128 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.89424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  45.26 
 
 
121 aa  87  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  43 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  40.57 
 
 
128 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  42.5 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  41.9 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.7247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  45.74 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  5.82879e-11 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  46.15 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  38.46 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  39.81 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  43 
 
 
118 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  41.03 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  39.62 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  34.86 
 
 
116 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  5.06445e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  37.19 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  42.42 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  38.26 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  4.77061e-08  unclonable  8.96903e-09 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  43.18 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  44.55 
 
 
122 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  43.01 
 
 
122 aa  84  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>