126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  65.68 
 
 		 687 aa  779    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  100 
 
 		 651 aa  1276    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  53.86 
 
 		 665 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  53.86 
 
 		 665 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  53.7 
 
 		 665 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  51.57 
 
 		 675 aa  602  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  55.1 
 
 		 676 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  54.4 
 
 		 672 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  48.64 
 
 		 686 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  44.84 
 
 		 642 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  45.31 
 
 		 678 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  44.79 
 
 		 664 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  43.46 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  43.46 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  43.34 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  44.39 
 
 		 692 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  42.65 
 
 		 646 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  43.4 
 
 		 681 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  45.53 
 
 		 632 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.5 
 
 		 731 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  41.6 
 
 		 651 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  41.23 
 
 		 679 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  40.13 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  41.01 
 
 		 708 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  37.61 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  39.82 
 
 		 722 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  38.99 
 
 		 631 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  53.02 
 
 		 661 aa  356  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  38.28 
 
 		 736 aa  353  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  44.93 
 
 		 671 aa  350  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  36.38 
 
 		 718 aa  349  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  38.33 
 
 		 708 aa  347  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  35.35 
 
 		 718 aa  346  8.999999999999999e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  40.06 
 
 		 719 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  38.13 
 
 		 697 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  36.58 
 
 		 752 aa  324  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  36.83 
 
 		 687 aa  319  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  35.89 
 
 		 711 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.15 
 
 		 683 aa  292  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.78 
 
 		 613 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  34.47 
 
 		 671 aa  269  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  45 
 
 		 654 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  45.94 
 
 		 319 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  39.27 
 
 		 310 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  41.57 
 
 		 322 aa  207  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.86 
 
 		 319 aa  205  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  41.34 
 
 		 322 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  40.28 
 
 		 328 aa  204  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  39.3 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  38.13 
 
 		 322 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  35.54 
 
 		 331 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  35.54 
 
 		 331 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  35.05 
 
 		 331 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  35.92 
 
 		 308 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.54 
 
 		 326 aa  150  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.25 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  28.57 
 
 		 653 aa  125  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.42 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.7 
 
 		 326 aa  110  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  31.29 
 
 		 387 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.14 
 
 		 354 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.71 
 
 		 343 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.16 
 
 		 327 aa  97.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  33.71 
 
 		 273 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  26.8 
 
 		 254 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  31.23 
 
 		 604 aa  86.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.91 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  24.82 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  22.76 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  28.06 
 
 		 264 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.79 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  33.44 
 
 		 339 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  30.03 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  24.44 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  24.44 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 270 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  30.8 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.22 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  28.77 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.47 
 
 		 265 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  26.39 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  22.14 
 
 		 300 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.61 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  28 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  24.39 
 
 		 289 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.96 
 
 		 266 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.76 
 
 		 300 aa  55.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.38 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  25.39 
 
 		 544 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  25.39 
 
 		 544 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.91 
 
 		 294 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  23.57 
 
 		 296 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>