More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  100 
 
 
358 aa  707    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3850  inner-membrane translocator  61.23 
 
 
388 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  62.32 
 
 
348 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2400  Monosaccharide-transporting ATPase  61.3 
 
 
334 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3727  Monosaccharide-transporting ATPase  61.86 
 
 
356 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587944  normal  0.0169743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10510  monosaccharide ABC transporter membrane protein  60.98 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1352  Monosaccharide-transporting ATPase  56.84 
 
 
345 aa  332  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.884414  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8258  ribose ABC transporter (permease)  62.46 
 
 
374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  decreased coverage  0.00803915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  45.15 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
311 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
311 aa  215  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  45.83 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  45.49 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  45.49 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  45.49 
 
 
311 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  45.49 
 
 
311 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  44.15 
 
 
311 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  44.16 
 
 
314 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  43.55 
 
 
323 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 
334 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 
334 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  38.89 
 
 
342 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
342 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.76 
 
 
327 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.76 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.39 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  41.93 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  43.42 
 
 
322 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3765  inner-membrane translocator  43.73 
 
 
306 aa  199  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00344833  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.73 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
341 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.53 
 
 
330 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 
330 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
345 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.53 
 
 
330 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
345 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.53 
 
 
333 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 
345 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  40.7 
 
 
343 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.7 
 
 
324 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.91 
 
 
338 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  42.41 
 
 
340 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.81 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 
345 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
345 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  42.51 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  42.95 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0502  monosaccharide-transporting ATPase  40.6 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475125 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  42.95 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  42.27 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
335 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  45.8 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40 
 
 
345 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 
835 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0886  ABC sugar transporter, inner-membrane subunit  40.31 
 
 
337 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0350071  normal  0.652921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3549  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
337 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5465  monosaccharide-transporting ATPase  40.31 
 
 
337 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.050328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4818  inner-membrane translocator  40.31 
 
 
337 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414014  normal  0.232318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2077  inner-membrane translocator  40.87 
 
 
333 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  43.39 
 
 
334 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
325 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.58 
 
 
331 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  39.05 
 
 
341 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.78 
 
 
306 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.69 
 
 
345 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.18 
 
 
345 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.18 
 
 
345 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 
347 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 
309 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
383 aa  185  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  39.56 
 
 
342 aa  185  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.75 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  40.55 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  37.13 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40.79 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  39.26 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  41.86 
 
 
310 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.86 
 
 
336 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  40.46 
 
 
310 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  43.26 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  38.75 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  39.02 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3785  monosaccharide-transporting ATPase  39.32 
 
 
337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2243  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 
337 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2473  monosaccharide-transporting ATPase  40.32 
 
 
330 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270103  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
336 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  41.86 
 
 
348 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  43 
 
 
339 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4199  inner-membrane translocator  39.08 
 
 
337 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  38.21 
 
 
338 aa  182  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  42.55 
 
 
324 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1921  inner-membrane translocator  41.25 
 
 
354 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  40.07 
 
 
322 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  40.92 
 
 
310 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  42.03 
 
 
340 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>