More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3062  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.59 
 
 
646 aa  851    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.57 
 
 
643 aa  824    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  53.85 
 
 
605 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1366  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  73.36 
 
 
642 aa  1002    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1536  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  63.51 
 
 
654 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.55086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3310  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  63.82 
 
 
655 aa  837    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959151  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2948  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.64 
 
 
614 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3283  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.24 
 
 
653 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524928  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.74 
 
 
635 aa  635    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3565  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  64.75 
 
 
651 aa  837    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120998  normal  0.0522713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.51 
 
 
633 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3049  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.08 
 
 
643 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.524302  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10620  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  100 
 
 
642 aa  1306    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.295992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  51.99 
 
 
633 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3299  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  63.82 
 
 
655 aa  837    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  51.16 
 
 
653 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3361  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  63.82 
 
 
655 aa  837    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12229  asparagine synthetase asnB  62.69 
 
 
652 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128709  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.1 
 
 
633 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3256  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  65.88 
 
 
634 aa  859    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00445489  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.24 
 
 
632 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  47.49 
 
 
630 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11980  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  38.43 
 
 
649 aa  433  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.658522  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.12 
 
 
649 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0474  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.74 
 
 
628 aa  384  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2533  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.32 
 
 
625 aa  363  7.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1938  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.49 
 
 
639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0135  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.38 
 
 
649 aa  355  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000081713  normal  0.012193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1379  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.97 
 
 
620 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000243161  normal  0.214624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2121  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.08 
 
 
653 aa  343  8e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.973734  normal  0.744167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.11 
 
 
632 aa  336  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.99 
 
 
638 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.83 
 
 
629 aa  327  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.65 
 
 
625 aa  326  9e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.04 
 
 
655 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.08 
 
 
619 aa  321  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.21 
 
 
646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.74 
 
 
655 aa  320  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.64 
 
 
639 aa  319  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.05 
 
 
629 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.9 
 
 
629 aa  317  6e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.2 
 
 
637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5373  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  35.01 
 
 
676 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.94 
 
 
639 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.53 
 
 
656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.53 
 
 
656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.53 
 
 
656 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.44 
 
 
634 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 
628 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.53 
 
 
655 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.53 
 
 
655 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.2 
 
 
643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.8 
 
 
634 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.04 
 
 
633 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 
656 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  34.95 
 
 
656 aa  303  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 
656 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 
656 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.77 
 
 
637 aa  303  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.9 
 
 
641 aa  303  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.43 
 
 
656 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.43 
 
 
656 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.43 
 
 
656 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  33.08 
 
 
637 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.1 
 
 
639 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.65 
 
 
635 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0472  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  34.39 
 
 
624 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.18 
 
 
632 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.12 
 
 
643 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.75 
 
 
647 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  34.53 
 
 
642 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.15 
 
 
650 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.91 
 
 
619 aa  293  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  35.32 
 
 
606 aa  293  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.49 
 
 
656 aa  291  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.87 
 
 
662 aa  290  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
641 aa  289  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.54 
 
 
631 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3228  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.81 
 
 
653 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31 
 
 
615 aa  287  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.02 
 
 
634 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.39 
 
 
643 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.16 
 
 
652 aa  283  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.3 
 
 
625 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.63 
 
 
656 aa  282  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.81 
 
 
596 aa  280  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.18 
 
 
631 aa  280  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.35 
 
 
647 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5298  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.59 
 
 
629 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.634266  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.53 
 
 
637 aa  277  6e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2127  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.12 
 
 
605 aa  276  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.53 
 
 
622 aa  276  9e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.09 
 
 
610 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>